南漳法国梅里埃培养基在土壤监测中，采样误差对结果的影响往往大于制样误差和分析误差。因此，在采样过程中应严格遵循采样的布点原则和方案，从采样过程中的每一个环节控制采样质量，尽可能地将采样的误差减至小，确保采集到的样品有充分的代表性，能真实反映土壤实际状况。培养基订购从野外取回的土样，经登记编号后，都需经过一个制备过程：风干、磨细、过筛、混匀和装瓶，以备各项测定之用。土壤重金属一般采用烘千样，半挥发性的持久性有机污染物的分析一般采用冷冻干燥样；挥发性有机污染物的测定一般用新鲜样。

南漳法国梅里埃培养基滤水管的长度取决于地下水位的深度，每个孔内，滤水管从井底一直延伸到高于静态水位以上约10 cm。监测井滤管周围用大于0.25 mm的干净石英砂回填作为滤水层，并填至滤管以上20 cm。填砂过程中缓慢地将不锈钢套管拔出以防管壁坍塌。培养基订购石英砂与地面以下的空间不填入任何东西。在采集完水样后，所有的PVC井管都被拔出，然后井孔用原土回填。

南漳法国梅里埃培养基指示菌用于品质鉴定的历史可追溯到饮料添加剂中的微生物检测，当时用大肠杆菌等肠道共生菌的检测来指示是否有肠道致病菌存在。培养基订购即大肠杆菌被用作指示菌（或我们所定义的指标菌），指示菌需满足以下条件：（1）凡有致病菌存在的地方就要有它的存在;2）数值要比致病菌多得多；（3）对环境或其他处罝过程的抵抗力比致病菌强。

南漳法国梅里埃培养基制备好的样品要妥善储存，避免日晒、高温、潮湿和酸碱等气体的污染。在全部分析工作结束，分析数据核实无误后，试样一般还要保存3个月至半年，以备查询。少数有价值需要长期保存的样品，培养基订购须保存于广口瓶中，用蜡封好瓶口。有条件的地方，样品应低温保存。指示菌"一词可用于任一群在分类学.生理学或生态学上相似的微生物.它们的存在与否可指示样品在过去或现在所具有的而不能直接证明的某些特征。