有些微生物是有利于研究人员做研究的，所以需要将这些微生物菌种好好的保存起来。保存这些微生物一般是运用的冷冻技术，首先需要对盛放微生物菌种的仪器进行杀菌和消毒处理，避免这种微生物与其他微生物混合在一起，饭后将培养皿放于低温状态下保存。
取0.1~0.2ml菌体悬浮液，移植于适宜的琼脂斜面、平板培养基上，剩余的菌液，注入适宜的液体培养基内，然后在建议的温度下培养。若未能活化，或活化后有疑问时，请于收到菌种1个月内，通知保藏中心，经查证无误后，即免费补寄。
注意事项：菌种活化前，请将安瓿管保存在6一10℃的环境下。厌氧菌的培养，如无特别说明，自开封至接种完成，均需以无氧气体充填，以保持厌氧状态。某些菌种经过冷冻干燥保存后，延迟期较长，需连续两次继代培养才能正常生长，此时请将步骤二重复一次。
液氮超低温保藏程序：容器的选择：使用带螺旋盖的2ml塑料安培瓶。检查安培瓶是否渗漏：用0.05%的亚甲基蓝水溶液在4℃浸泡30-45分钟，冲洗干净，弃去含有蓝色染料的安培瓶，其余的安培瓶备用。容器的灭菌：先用蒸馏水漂洗干净安培瓶，再用蒸馏水在灭菌锅中121℃浸泡灭菌15分钟，干燥并将打印好的标签放入安培瓶中，略拧紧螺旋盖，再行121℃灭菌30分钟。
保藏菌菌龄：处于生长量阶段或对数生长期后期。保护剂：选用5-10%的甘油或二甲基亚砜作保护剂。甘油的准备：在121℃灭菌15分钟，2-8℃贮存。甘油一般以两倍所需浓度的水溶液保存，然后与同等量的细胞悬液混合。若不用细胞悬液，则以所需浓度的水溶液保存。
二甲基亚砜：用0.22um的聚四氟乙烯过滤膜过滤除菌。过滤膜预先用甲醇和二甲基亚砜漂洗。无菌的二甲基亚砜以10-15ml装量2-8℃避光保存。分装：在无菌条件下，将细胞悬液分装于安培瓶中，并注入保护剂，拧紧螺旋盖。
