常用的消毒剂以成分分类主要有9种：含氯消毒剂、过氧化物类消毒剂、季铵盐类消毒剂、含碘消毒剂、醛类消毒剂、醇类消毒剂、酚类消毒剂、杂环类消毒剂、胍类消毒剂，另外还有生物类消毒剂。

1、含氯消毒剂

运用领域：水消毒、环境消毒、器具消毒等方面。

溶于水发生具有杀微生物活性的次氯酸的消毒剂，其杀微生物有效成分常以有效氯表示。次氯酸分子量小，易扩散到细菌外表并穿透细胞膜进入菌体内，使菌体蛋白氧化导致细菌死亡。含氯消毒剂可杀灭各种微生物，包含细菌繁殖体、病毒、真菌、结核杆菌和抗力很强的细菌芽胞。这类消毒剂包含无机氯化合物(如次氯酸钠、次氯酸钙、氯化磷酸三钠)、有机氯化合物(如二氯异氰尿酸钠、三氯异氰尿酸、氯铵T等)。无机氯性质不稳定，易受光、热和潮湿的影响，损失其有效成分，有机氯则相对稳定，但是溶于水之后均不稳定。

2、过氧化物类消毒剂

常见的有过氧乙酸、过氧化氢、过氧戊二酸。 过氧乙酸用途普遍，缺点是不稳定，对金属的腐蚀性较大。过氧化氢主要用于空气消毒、皮肤消毒、粘膜消毒。过氧戊二酸稳定性好于过氧乙酸和过氧化氢，但成本高，市场上基本见不到。臭氧消毒在纯净水厂运用普遍，主要是消毒之后无残留。

二氧化氯

运用领域：水消毒、器具消毒、环境消毒、食品消毒等方面。

二氧化氯对细胞壁有较强的吸附和穿透才能，放出原子氧将细胞内的含巯基的酶氧化起到杀菌效果。国外很多的实验研究显现,二氧化氯是安全、无毒的消毒剂,无“三致”效应(致癌、致畸、致骤变),同时在消毒过程中也不与有机物发生氯代反响生成可发生“三致效果”的有机氯化物或其它有毒类物质。但由于二氧化氯具有极强的氧化才能，应避免在高浓度时(>500ppm)运用。二氧化氯消毒剂被公认是很高效、安全环保的消毒剂。

3、醛类消毒剂：福尔马林溶液与高锰酸钾合作运用

包含甲醛和戊二醛等。此类消毒原理为一种生动的烷化剂效果于微生物蛋白质中的氨基、羧基、羟基和巯基，从而损坏蛋白质分子，使微生物死亡。甲醛和戊二醛均可杀灭各种微生物，由于它们对人体皮肤、黏膜有影响和固化效果，并可使人致敏，因而不行用于空气、食具等消毒，一般仅用于医院中医疗器械的消毒或灭菌，且经消毒或灭菌的物品必须用灭菌水将残留的消毒液冲洗干净后才可运用。

运用领域：熏蒸消毒，戊二醛首要用于医疗器械的消毒。