由于原料不同，培养基的使用要求也不同，储存和贮藏也略有不同。一般培养基经、加热吸湿后，容易被细菌污染或分解。因此，普通培养基得要保存在防潮的、阴凉处，远离光线、。一些需要严格灭菌的培养基(如组织培养基)得要在3-6的冰箱中长期保存。由于液体培养基不易长时间保存，所以改为粉末。

当培养基中的营养浓度合适时，微生物可以很好地生长。当营养浓度过低时，不能满足微生物正常生长的需要。当浓度过高时，可能会阻止微生物的生长。比如高浓度的糖、无机盐、重金属离子不能维持和促进微生物的生长，而是起到抗菌或杀菌的作用。

因此，培养基要经过验证的灭菌程序进行灭菌，培养基的灭菌方法和前提要经过无菌试验和促生长试验验证。温度缓慢上升的高压釜可能会导致培养基过热，过度灭菌可能会破坏大多数细菌和真菌培养基的促生质量。如果培养基加热和灭菌不当，可能会导致颜色变化、透明度降低、琼脂凝固力或酸碱度变化。灭菌器中培养基的体积和装载方式也会影响加热速度。因此，灭菌程序的各个方面都要根据灭菌介质的特性进行验证。此外，保证了一定加载方式下的正常热量分布。

制成平板或包装在试管中的培养基应进行如下检查：容器和盖子不应破裂，装量应相同，尽量避免气泡，固体培养基表面不应产生裂纹或波纹，冷藏温度下不应形成晶体，微生物不应受到污染等。检查并记录批号、有效期和培养基无菌检查。